┌─○忠脩　─────○長次　　　　　　　　　　　　　┌─○長逵　───┬─○長為　───┬─○長禎　─────○長武　─────●忠幹　───┐
　　　　　　　　　│　　　　　　　　　　　中津小笠原家　　　　　　　　　│　　安志小笠原家│　　　　　　　　│　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　│
　　　　　　　　　│　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　│　　　　　　　　│　　　　　　　　│　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　│
　　●秀政　───┼─●忠真　───┬─●忠雄　───┬─●忠基　───┴─●忠総　　　　└─●忠苗　　　　└─●忠固　─────●忠徴　　　　　　　　　　　　　│
　　　小笠原貞慶男│　　　　　　　　│　　　　　　　　│　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　│
　　　室松平氏　　│　　　　　　　　│　　　　　　　　│　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　│
　　　　　　　　　└─○忠知　　　　└─○真方　　　　└─○貞通　─────○貞顕　─────○貞温　─────○貞哲　─────●忠嘉　　　　　　　　　　　　　│
　　　　　　　　　　　　唐津小笠原家　　　千束小笠原家　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　│
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　│
　　　　　　　　　┌───────────────────────────────────────────────────────────────────────┘
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　　　　　　　　　├─○貞孚
　　　　　　　　　│　　小笠原子爵家
　　　　　　　　　│
　　　　　　　　　└─●忠忱
　　　　　　　　　　　　小笠原伯爵家

1. 小笠原秀政（1569-1615）　古河藩主、飯田藩主、松本藩主。
   • 小笠原忠脩（1595-1615）

2. 小笠原忠真　松本藩主、明石藩主、藩主（1632-1667）。
3. 小笠原忠雄　藩主（1667-1725）。
4. 小笠原忠基　藩主（1725-1752）。
5. 小笠原忠総　藩主（1752-1790）。
6. 小笠原忠苗　藩主（1791-1804）。
7. 小笠原忠固　藩主（1804-1843）。
8. 小笠原忠徴　藩主（1843-1856）。
9. 小笠原忠嘉　藩主（1856-1860）。
10. 小笠原忠幹　安志藩主、藩主（1860-1865）。
11. 小笠原忠忱　藩主（1865-1871）、伯爵。